El proyecto Sistema Universidad Virtual inicia en el año 2005, con la implementación del Diplomado Introducción a la Educación Virtual el cual en sus inicios empezó con 90 profesores, a partir de la fecha iniciaron en la Universidad materias mixtas para los alumnos: parte presencial y parte virtual.

Con fecha del 8 de agosto de 2009, la Universidad Juárez del Estado de Durango, implementa el Sistema Universidad Virtual con la finalidad de ofrecer seis programas educativos e impactar de una manera positiva con recurso tecnológico en la búsqueda de la impartición del conocimiento a un mayor número de población en el Estado de Durango, firmando el Convenio de Colaboración Académica el día 28 de septiembre de 2009 con los municipios de Canatlán, Nuevo Ideal y Santiago Papasquiaro, y el día 29 de septiembre del mismo año con El Salto, Pueblo Nuevo y Guadalupe Victoria.

Con este logro la UJED, se unió durante este año a las 39 universidades del país agrupadas en el ECOESAD, que por primera vez ofertan 16 licenciaturas, para llegar a más de 10 mil 300 estudiantes, en donde la UJED inicia su participación con seis programas que se ofrecen en esta modalidad a distancia, en los cuales se inició con 308 alumnos: 68 estudiantes de Nivelatorio en Enfermería, 16 en el programa Nivelatorio de Trabajo Social, 40 del programa Ingeniero Fruticultor, 33 en el Programa de Contador Público, 41 en la carrera de Licenciado en Administración y 110 alumnos del programa de Licenciatura en Psicología.

Para ofrecer los programas mencionados anteriormente, se contó con el apoyo de las unidades académicas universitarias siguientes: Facultad de Agronomía y Zootecnia, Facultad de Economía, Contaduría y Administración, Facultad de Enfermería y Obstetricia, Facultad de Trabajo Social y Escuela de Psicología y Terapia de la Comunicación Humana. En el año 2010, se firman los convenios para la implementación de los programas a Distancia de la UJED. con los municipios de Vicente Guerrero y Rodeo.